玄妙观重修三门记碑 　原在正山门内，为元代牟峨撰文、赵孟顺书并篆额。“文革”时失落。1990年，苏州碑刻博物馆受市道教协会委托，仿刻成碑，现存正山门内。

　　麒麟照墙 　原坐落于雷祖殿对面。为照墙壁画。所绘一头黑麒麟传为雷尊坐骑。民国初期，苏州救火会倚该照墙设置太平缸时将麒麟刷去，致此景不存。

　　朝北玄帝铜殿 　又称武当山金顶铜殿、祖师殿。原在文昌殿前庭，系铜合金浇铸的道教圣地武当山的模型殿，长2米、宽1．3米、高1．3米。据说为元代遗物，内供北极玄天大帝，故一破殿宇均朝南惯例，独该殿为朝北放置，故名“朝北玄帝铜殿”。“文革”期间此殿为苏州博物馆收藏，后归还，现存三清殿神台东侧。

　　

     六角亭 　原在玄妙观主殿三清殿露台西侧，与露台东侧的四角亭遥相呼应，两亭均于清咸丰年间被毁。今已重建。

　　钉钉石栏杆 　为环绕三清殿前露台周围的青石栏杆，底座上刻有“封侯挂印”、“麒麟祝寿”、“双龙戏珠”、“仙鹿衔草”等图案，为五代遗物，石刻至今依稀可辨。因其立柱与露台基座连接处以熔化后的生铁浇连，宛如钉子钉牢一般，故名。

　　

一步三条桥 　在三清殿露台东侧石阶下，为平排的三块青石，仿佛似桥面一般，一步即能跨越，故名。传原石阶下有鱼自穴中跃出，民国时石下水穴已壅塞。

　　无字碑 　在三清殿东侧。为一块高6.7米宽2.7米的石碑。据史料记载，此碑上原刻有字。明洪武四年(1371年)，清理道教，更玄妙观为“正一丛林”，置道纪司，革香火田充军饷，建文帝侍读学士方孝孺作记，刻于碑上，书法铁划银钩，不同凡响。后明成祖朱棣从其侄手中夺得皇位，称永乐帝，命方孝孺草登位诏告天下。方孝孺坚守儒家正统观念，气节凛然，宁死不从，被诛灭十族，甚至连此碑亦未幸免，所书碑文，悉被铲除，不留一字，于是留下一块表现封建士大夫气节的无字碑。

　　海井 　传三清殿内九霄天尊(虚皇)座下有口井，甚深，投石井中，许久才听到水声，有海眼涛声之称。现已废。

　　石水盂 　在弥罗宝阁前，有一长2．7米、宽1．3米，呈半圆状的盂形水池。传说有一道人买了一条咸鲤鱼置于盂水中，鲤鱼居然死而复活。现已废。